Pressmeddelande -
Databas för genforskning om bland annat alzheimer och cancer utökas
Bild: Erik Sonnhammer Fotograf: Maria Sanqdqvist
Den unika databasen FunCoup skapades för tre år sedan vid Stockholms Universitet. Den utökas nu och är idag ett viktigt redskap för genforskare runt om i världen när det gäller exempelvis forskning om alzheimer och olika cancersjukdomar.
– Det finns ett par databaser till runt om i världen, men inte med samma innehåll som vår. Det finns så lite kunskap om hur gener interagerar och därför är FunCoup ett viktigt bidrag till genforskningen, säger Erik Sonnhammer, professor i bioinformatik.
Forskare vid Stockholms Bioinformatik Centrum (SBC) har vidareutvecklat och utökat sin databas med nätverk av proteiner och gener som interagerar funktionellt med varandra. Arbetet publicerades i Januarinumret av tidskriften Nucleic Acids Research, och nätverken är tillgängliga för forskare och andra intresserade via en webbaserad portal.
Sedan starten i juli 2009 har antalet besökare till FunCoup stadigt ökat och ligger idag på ca 500 unika besökare i månaden. Tjänsten är gratis och betalas med forskningsanslag.
– Det är samma webbgränssnitt över hela världen. Det innebär att en forskare i Brasilien eller USA kan gå in och använda databasen, likväl som en norsk eller svensk forskare, berättar Erik Sonnhammer.
– Fördelen med FunCoup är att den snabbar upp forskningen! Ger svar på nya hypoteser. I stället för att göra tidskrävande experiment kan forskarna ha tillgång till all hittills känd kunskap om olika gener i en och samma databas. Den kan exempelvis handla om nya kandidater till nya cancergener, förklarar Erik Sonnhammer.
Databasen med verktyg för att analysera nätverken runt valfria gener finns på http://FunCoup.sbc.su.se/
Artikeln i Nucleic Acids Research: http://nar.oxfordjournals.org/content/40/D1/D821.long
Ytterligare information:
Erik Sonnhammer, professor i bioinformatik, Stockholms Bioinformatik Centrum, Stockholms universitet, tfn 08-52481184, 070-5586395, e-posthttp://mce_host/se/edit/pressreleases/%20Erik.Sonnhammer@sbc.su.se
Ämnen
Regioner
Vi är ett av Europas ledande universitet i en av världens mest dynamiska huvudstäder. Hos oss är fler än 60 000 studenter, 1800 doktorander och 5000 medarbetare verksamma inom det naturvetenskapliga och humanistisk-samhällsvetenskapliga området. En relation med Stockholms universitet är meriterande oavsett om du är student, forskare eller intressent. Hos oss ger utbildning och forskning resultat.
www.su.se
